个人简介

南方科技大学海洋科学与工程系助理教授，博士生导师，独立PI，微生物信息学实验室（Lab of Microbial Informatics）负责人。毕业于浙江大学和澳大利亚新南威尔士大学，曾在澳大利亚昆士兰大学和深圳华大基因工作。研究方向包括微生物生态与进化、微生物共生、微生物组与病毒组互作、结构微生物学等。曾以第一或通讯作者，在Nature Ecology & Evolution、Nature Communications、PNAS、PNAS Nexus、Engineering、ISME J等期刊上发表研究成果。已主持国家自然科学基金重大研究计划培育项目、面上项目等。曾获欧洲微生物学会（FEMS）青年科学家奖，澳大利亚新南威尔士州海洋科学最佳研究奖。

教育背景

2008－2012：新南威尔士大学（University of New South Wales），微生物学与免疫学，博士

2006－2008：浙江大学，生物物理学，硕士

2002－2006：浙江大学，应用生物科学，学士

工作经历

2021－至今：南方科技大学，助理教授

2017－2021：南方科技大学，研究助理教授

2015－2017：深圳碳云智能科技有限公司，高级产品经理

2014－2015：深圳华大基因研究院，研究员

2012－2014：昆士兰大学（University of Queensland），博士后研究员

荣誉奖项

1、2014年澳大利亚新南威尔士州“海洋环境科学年度最佳研究奖”

2、2011年第四届欧洲微生物学联合会（FEMS）欧洲以外青年科学家奖（全球20人）

科研项目

1、国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，2024-2029，子课题负责人

2、国家自然科学基金面上项目，“河口盐度作用下玫瑰杆菌和病毒群体微观多样性产生机制研究”， 2024 - 2027，主持

3、国家自然科学基金重大研究计划培育项目，“病毒调节MGII古菌参与河口碳氮循环的机制研究”，91951120，2020 – 2022，主持

4、深圳市基础研究自由探索项目，“深圳湾土著微生物的抗污研究与开发”，JCYJ20180305123458107，2019 – 2021，主持

发表论著

代表性论文（*通讯作者）：

1、Wang W, …, Thomas T*, Fan L*. Decoupling of strain- and intrastrain-level interactions of microbiomes in a sponge holobiont. Nature Communications 15, 8205 (2024). 

2、Fan L* , …, Zhang C*. Gene inversion led to the emergence of brackish archaeal heterotrophs in the aftermath of the Cryogenian snowball earth. PNAS Nexus pgae057 (2024).
3、Fan L*, Wu D, Vadim G, …, Martin WF*, Zhu RX*. Phylogenetic analyses with systematic taxon sampling show that mitochondria branch within Alphaproteobacteria. Nature Ecology & Evolution 4, 1213-1219 (2020).

4、Fan L, Liu M, Simister R, Webster NS, Thomas T*. Marine microbial symbiosis heats up: the phylogenetic and functional response of a sponge holobiont to thermal stress. ISME J 7:991-1002 (2013).

5、Fan L, Reynolds D, Liu M, Stark M, Webster NS, Kjelleberg S, Thomas T*. Functional equivalence and evolutionary convergence in complex communities of microbial sponge symbionts. Proc Natl Acad Sci U S A 109:E1878-E1887 (2012).

学术与社会职位

mLife期刊青年编委